Davin Hadryanto Ekaputra SETIAMARGA
Davin H. E. SETIAMARGA
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在籍時： 東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻 動物学大講座
現： University of California, San Diego 特任研究員
出身地： 西ジャワ州、インドネシア
トウゴロウイワシ系魚類は、人間生活にとって重要なだけでなく、研究上でも大変重要なグループです。食材として重要なサンマ、トビウオ、サヨリなどが含まれる一方で、生物学実験によく用いられるグッピーやメダカなどが含まれているからです。とくにメダカは、モデル生物として多方面の生物学的研究に用いられており、ゲノムの解読も行なわれています。
このように重要な魚種を含んでいるにもかかわらず、トウゴロウイワシ系魚類の系統関係は、未だ十分に解明されていません。これまで形態形質に基づいて様々な系統仮説が提唱されていますが、未だに一致した見解は得られていないのです。これまでメダカやグッピーについて様々なことが明らかになっていますが、その進化的な意味を近縁種との比較に基づき正しく議論することは、まだできないのが現状です。
そこで私は、分子系統学的手法を用いて、トウゴロウイワシ系魚類の系統関係を明らかにすることを研究目的としました。手法としては、これまで魚類の高次系統を明らかにするのに有用であることが我々の研究グループにより明らかになっているミトコンドリア DNA の全塩基配列に基づく系統解析を用いています。サンプルは、出身国であるインドネシアを中心に収集しています。
研究業績
学術論文
- Kimiko Tanaka, Satoshi Ohisa, Nobuaki Orihara, Sae Sakaguchi, Kyohei Horie, Kenta Hibiya, Sayaka Konno, Akimitsu Miyake, Davin Setiamarga, Hiroyuki Takeda, Yoshiyuki Imai and Akira Kudo. 2004.
Characterization of mutations affecting embryonic hematopoiesis in the medaka, Oryzias latipes. Mechanisms of Development, Vol. 121, p. 739-746.
- Motoki Hojo, Shigeo Takashima, Daisuke Kobayashi, Akira Sumeragi, Atsuko Shimada, Tatsuya Tsukahara, Hayato Yokoi, Takanori Narita, Tomoko Jindo, Takahiro Kage, Tadao Kitagawa, Tetsuaki Kimura, Koshin Sekimizu, Akimitsu Miyake, Davin Setiamarga, Ryohei Murakami, Sachiko Tsuda, Shinya Ooki, Ken Kakihara, Kiyoshi Naruse, Hiroyuki Takeda. 2007. Right-elevated expression of charon is regulated by fluid flow in medaka Kupffer's vesicle. Development, Growth and Differentiation, 49 (5): 395-405.
- Shigeo Takashima, Atsuko Shimada, Daisuke Kobayashi, Hayato Yokoi, Takanori Narita, Tomoko Jindo, Takahiro Kage, Tadao Kitagawa, Tetsuaki Kimura, Koshin Sekimizu, Akimitsu Miyake, Davin H. E. Setiamarga, Ryohei Murakami, Sachiko Tsuda, Shinya Ooki, Ken Kakihara, Motoki Hojo, Kiyoshi Naruse, Hiroshi Mitani, Akihiro Shima, Yuji Ishikawa, Kazuo Araki, Yumiko Saga, Hiroyuki Takeda. 2007. Phenotypic analysis of a novel chordin mutant in medaka. Developmental Dynamics 236: 2298-2310.
- Davin H. E. Setiamarga, Masaki Miya, Yusuke Yamanoue, Kohji Mabuchi, Takashi P. Satoh, Jun G. Inoue, Mutsumi Nishida. inpress.Interrelationships of Atherinomorpha (medakas, flyingfishes, killifishes, silversides, and their relatives): The first evidence based on whole mitogenome sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2008.08.008
修士論文
「体節形成に異常を示すメダカ突然変異体の発生遺伝学的解析（Phenotypic and Genetic Analyses of A Mutant Medaka With Defected Somitogenesis）- in Japanese」東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻 動物学大講座 動物発生学研究室（指導教官：武田洋幸教授），2005年1月．
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Last modified: 13 May, 2009
